本會於88水患的救災工作已由救災階段漸漸轉入「災後重建」階段。由於救災期間，教會秉持「肢體苦難同擔」的精神，獲得各界不少肯定。

由於屏東瀕海災區嚴重淹水，日久滋生細菌極易感染造成疫癘。早在救災第二週，志工不斷由各地方湧入，救災指揮中心洪牧師極為擔憂，幾度向政府衛生單位反應，盼能為志工之安全著想施打預防針。可以未獲有關單位之回應。

9月5日，洪牧師接獲電話告知，由工研院研究之奈米科技應用在消毒已研發出「奈米科技消毒機」，並且已獲得全世界多國專利。將"第一台"提供贈送給教會使用。9月6日，由新竹專車送到彌迦教會組裝完成，並由議長黃美俐牧師以及教社部代表洪叡郎牧師接受。該機器成本約30餘萬台幣，由台灣廣播公司馬長生董事長奉獻。

目前已加工製成輪車堆動的消毒水製造機，以便送至重建站使用。